Sensibilité du scanner thoracique dans le diagnostic de la pneumonie à SARS – COV 2 à propos de 229 cas.
DOI :
https://doi.org/10.55715/jaim.v13i4.279Mots-clés :
Sensitivity, CT, pneumonia, COVID 19.Résumé
Purpose: to assess the sensitivity of the scanner in the diagnosis of pneumonia to Covid-19 in our service by considering the RT-PCR of oropharyngeal secretions as a reference examination.
Methodology: Cross-sectional and descriptive study carried out from January 1 to August 31, 2020, in the medical imaging department of the Polyclinic Pasteur, Bamako. Inclusion criteria were all patients with Real Time Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) positive oropharyngeal swabs and / or CT suggestive of COVID 19 pneumonia. Data analysis was performed at using SPSS software version 19.0. Data analysis (socio-demographic, clinical; biological and radiological) was performed using SPSS software version 19.0. The 5% threshold was decided on the significance of the variables analyzed. The sensitivity of chest CT was calculated using the relationship, Sensitivity = VP / (TP + FN), TP: true positive CT: patients with positive CT with positive RT PCR and FN: False negative CT: patients with negative CT and with positive RT PCR test.
Results: 229 cases of COVID 19 were treated for 221 cases of COVID 19 pneumonia during our study period. The average age was 36 years old. The sex ratio was 2.4. Clinical examination was dominated by cough (44.54%) and dyspnea (25.33%). We found desaturation in 39.74% of cases. The PCR test was positive in 87.34% of cases. The high-resolution no-injection protocol dominated the initial review, accounting for 64% of cases. Lung lesions were dominated by ground glass opacities in 88.65%. The preferred site of lesions was inferior lobar, ie 80.28%. Lung involvement was bilateral in 80.79% of cases. Pulmonary embolism (5.24%) and pleurisy (3.93%) were associated with parenchymal damage. The topography of the parenchymal lesions was mixed (central and peripheral) in 79.48% of cases, it was pure peripheral in 13.54%. The RT-PCR test was positive in almost all of our patients, ie 87.34%. Two or more control scans were performed in 20.96% of our patients. The initial CT scan was positive in 96.51% of cases. In our study, the sensitivity of the CT scan was 96.51% with a specificity of 12.66%.
Conclusion: The chest scanner quickly established itself among the first-line diagnostic tools with a high sensitivity, ie 96.51% in our study.
RESUME
Objectif : évaluer la sensibilité du scanner dans le diagnostic de la pneumonie à Covid-19 dans notre service en considérant la RT-PCR des sécrétions oropharyngées comme examen de référence.
Méthodologie : Etude transversale et descriptive réalisée du 1er janvier au 31 août 2020, dans le service d’imagerie médicale de la polyclinique Pasteur, Bamako. Les critères d'inclusion étaient tous les patients avec une Réaction en Chaîne de la Polymérase en Temps Réel (RT-PCR) des écouvillons oropharyngés positive et/ou une TDM évocatrice de pneumonie à COVID 19. L’analyse des données a été faite à l’aide de logiciel SPSS version 19.0. L’analyse des données (sociodémographique, clinique ; biologique et radiologique) a été faite à l’aide de logiciel SPSS version 19.0. Le seuil de 5% a été décidé de la significativité des variables analysées. La sensibilité de la TDM thoracique a été calculée à l’aide de la relation, Sensibilité=VP/ (VP+FN), VP : vrai positif de la TDM : patients présentant la TDM positive avec le test RT PCR positif et le FN : Faux négatif de la TDM : patients présentant la TDM négative et avec le test RT PCR positif.
Résultats : Il a été pris en charge 229 cas de COVID 19 pour 221cas de pneumonie à COVID 19 pendant notre période d’étude. L’âge moyen était de 36ans. Le sexe ratio était de 2,4. L’examen clinique était dominé par la toux (44,54 %) et la dyspnée (25,33%). Nous avons constaté une désaturation chez 39,74% des cas. Le test PCR était positif chez 87,34% des cas.
Le protocole sans injection haute résolution a dominé l’examen initial soit 64 % des cas.
Les lésions pulmonaires étaient dominées par des opacités en verre dépoli dans 88,65%. Le siège de prédilection des lésions était lobaire inférieur soit 80,28%. L’atteinte pulmonaire était bilatérale dans 80,79% des cas. L’embolie pulmonaire (5,24%) et la pleurésie (3,93%) étaient associées aux lésions parenchymateuses. La topographie des lésions parenchymateuse était mixte (centrale et périphérique) chez 79,48% des cas, elle était périphérique pure dans 13,54%. Le test RT-PCR était positif chez la quasi-totalité de nos patients soit 87,34%.
Deux ou plusieurs scanners de contrôles ont été réalisés chez 20,96% de nos patients.
le scanner initial était positif dans 96,51% de cas Dans notre étude, la sensibilité du scanner était de 96,51% avec une spécificité de 12,66%.
Conclusion : Le scanner thoracique s’est imposé rapidement parmi les outils diagnostiques de première ligne avec une sensibilité élevée soit 96,51% dans notre étude.
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Références
2. Ministère de la Santé et du développement Social du Mali. Situation épidémiologique de la 1ère semaine de l’année 2021.http://www.sante.gov.ml/index.php/2014-11-10-17-29-36/documents-standards/item/5958-situation-epidemiologique-de-la-1ere-semaine-de-l-annee-2021(consulté le 10 janvier 2021).
3. Corman VM, Landt O, Kaiser M, Molenkamp R, Meijer A, Chu DK et al. Detection of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) by real-time RT-PCR. Euro Surveill 2020;25(3): 2000045.
4. Scott J. Adams MD, Carole Dennie MD. L’imagerie thoracique chez les patients soupçonnés d’avoir la Covid-19. CMAJ 2020 ; 192(46) : E1494-E1494. doi : 10.1503/cmaj.200626-f.
5. Whu C ; Chen X Cai Y Xia J. Risk factors associated with acute respiratory distress syndrome and death in patients with coronavirus disease 2919 pneumonia in Wuhan, China. JAMA internal medicine 2020 ; 180(7) : 934-943.
6. Mizumoto K, Kagaya K, Zarebski A et Chowell G. Estimating the asymptomatic proportion of coronavirus disease 2019 (COVID-19) cases on board the Diamond Princess cruise ship, Yokohama, Japan. Euro surveillance 2020 ;25(10) : 2000180.
7. Plaçais L, Richier Q. COVID-19 : caractéristiques cliniques, biologiques et radiologiques chez l’adulte, la femme enceinte et l’enfant. Une mise au point au cœur de la pandémie. La Revue de médecine interne 2020 ; 41 :308-318.
8. Kashongwe I.M, Lepira F.B, Tuma H.N, Situakibanza J.R.R M, Sumaili E.K, Ntumba J.M, Murhula I.K. Manifestations cliniques de l’infection à Coronavirus SARS-Cov-2 (COVID-19). Ann. Afr. Med 2020 ; 13(3) : e3685-e3693.
9. Guan W, Ni Z, Yu Hu, Liang W, Ou C, He J et al. Clinical Characteristics of Coronavirus Disease 2019 in China. N Engl J Med 2020 ; Feb 28. doi: 10.1056/NEJMoa2002032.
10. UpToDate.https://www.uptodate.com/contents/coronavirus-disease-2019-covid-19. Consulté le 10 janvier 2021.
11. Hu Z, Song C, Xu C, Jin G, Chen Y, Xu X et Shen H. Clinical characteristics of 24 asymptomatic infections with COVID-19 screened among close contacts in Nanjing, China. Science China Life Sciences 2020 ; 63(5) : 706-711.
12. Guan W, Ni Z, Yu Hu, Liang W, Ou C, He J et al. Clinical Characteristics of Coronavirus Disease 2019 in China. N Engl J Med 2020 ; Feb 28. doi: 10.1056/NEJMoa2002032.
13. Niang I, Diallo I, Diouf Ndoffene CJ, Ly M, Toure MH et al.Tri et détection du Covid-19 par TDM thoracique low-dose chez les patients tout-venant au service de radiologie de l’Hôpital de Fann (Dakar-Sénégal). The Pan African Med Journal 2020 ; 37 (Supp 1) :22.
14. Okada P, Buathong R, Phuygun S, Thanadachakul T, Parnmen S, Wongboot W et Maurer-StrohS. Early transmission patterns of coronavirus disease 2019 (COVID-19) in travelers from Wuhan to Thailand, January 2020. Euro surveillance 2020 ; 25(8) :2000097.
15. Wang Y, Dong C, Hu Y, Li C, Ren Q, Zhang X, Shi H, Zhou M. Temporal changes of CT findings in 90 patients with COVID-19 pneumonia. A longitudinal study. Radiology 2020 ; 296 : E55-E64.
16. Lodé B, Jalaber C, Orcel T, Morcet-Delattre T, Crespin N, Voisin S et al. Imagerie de la pneumonie COVID-19. Journal d’imagerie diagnostique et interventionnelle 2020 ; 3: 249-258.
17. Bernheim A, Mei X, Huang M, Yang Y, Fayad Z.A, Zhang N et al. Chest CT findings in Coronavirus Disease 2019 (COVID-19): Relationship to Duration of Infection. Radiology 2020 ; 295 : 685-691.
18. Wong FHY, Lam HYS, Fong AHT, Leung ST, Chin TWY, Lo CSY et Ng MY. Frequency and distribution of chest radiographic findings in patients positive for COVID-19. Radiology 2020; 296: E72-E78.
19. Salehi S, Abedi A, Balakrishnan S et Gholamrezanezhad A. Coronavirus disease 2019 (COVID-19): a systematic review of imaging findings in 919 patients. American Journal of Roentgenology 2020 ; 215(1), 87-93.
20. Revel M-P, Parkar AP, Prosch H, Silva M, Sverzellati N, Gleeson F, Brady A. COVID-19 patients and the radiology department – advice from the European Society of Radiology (ESR) and the European Society of Thoracic Imaging (ESTI). European Radiology 2020 ; 30 :4903-4909.
21. Ming-Yen Ng, Elaine YP Lee, Yang Jin, Xiali Li FY, Wang H et al. Imaging profile of the COVID-19 infection: radiologic findings and literature review. Radiology: Cardiothoracic Imaging 2020;2(1) :e200034. https://doi.org/10.1148/ryct.2020200034.
22. Zuily S, Dufrost V, Wahl D. Thrombose artérielle et veineuse au cours du Covid-19. Arch Mal cœur Vaiss Prat 2020 ; 2020 : 16-19.
23. Yang R, Li X, Liu H, Zhen Y, Zhang X, Xiong Q et Zeng W. (2020). Chest CT severity score: an imaging tool for assessing severe COVID-19. Radiology: Cardiothoracic Imaging 2020; 2(2) : e200047.24. https://ebulletin.radiologie.fr/covid19.
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